内科系

• 神经内科第一病区
• 神经内科第二病区
• 消化内科
• 呼吸与危重症医学科
• 心内科
• 内分泌科
• 肾内科

外科系

• 骨科第一病区
• 骨科第二病区
• 普外科第一病区
• 普外科第二病区
• 泌尿外科
• 心胸外科
• 神经外科
• 麻醉科
• 中心手术室
• 门诊手术室
• 外科门诊

干诊系

• 老年医学科第一病区（干诊科第二病区）
• 感染性疾病科（干诊科第三病区）
• 老年医学科第二病区（干诊科第四病区）
• 全科医学科

急诊科系

• 120急救指挥中心
• 急诊科门诊
• 急诊科抢救室
• 急诊科留观室
• 重症医学科

五官科系

• 眼科
• 口腔综合门诊
  • 口腔综合门诊
  • 口腔内科
  • 牙周专科
  • 口腔正畸科
  • 口腔放射线科
  • 口腔修复科
• 口腔颌面外科
• 耳鼻咽喉科

其他科系

• 药学部
• 医学影像科
• 医学检验科
• 超声医学科
• 病理科
• 基因研究室
• 输血科
• 放疗科
• 介入手术室
• 皮肤科
• 内分泌科代谢门诊
• 血液净化中心
• 高压氧科
• 营养科
• 心理门诊
• 疼痛门诊
• 眩晕门诊
• 高血压门诊
• 肛肠门诊
• 帕金森专病门诊
• 护理服务中心
• 康复理疗科
• 神经内科门诊
• 核医学科

本溪市中心医院东兴分院

• 健康管理中心

本溪市中心医院太子河新城院区

• 肿瘤内科
• 血液内科
• 风湿免疫科
• 中西医结合科
• 康复医学科
• 综合门诊

本溪市中心医院医疗集团金山医院/妇儿医院

• 妇科系
  • 妇科第一病区
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  • 儿童康复中心
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  • 儿童健康管理中心